【small RNA云平台专题】miRNA+tsRNA双维云平台,一键解锁高分标志物
在基因组学的浩瀚星海中编码蛋白的基因仅占不到 2%而剩余 98% 的暗物质——非编码 RNA正悄然改写我们对疾病发生发展的认知。其中长度不足 200 nt 的 Small RNA 家族尤其是 miRNA 与 tsRNA已成为肿瘤标志物筛选、疾病机制解析和精准医学领域最炙手可热的研究靶点。派森诺基因云推出的 医学 Small RNA 云平台让科研者无需配置 Linux、无需安装复杂软件即可在浏览器中完成从数据质控到 biomarker 挖掘的全流程分析。01 miRNA经典调控分子医学研究的黄金标准miRNA(microRNA) 作为 Small RNA 家族中研究最为广泛的成员通过结合靶基因 mRNA 的 3UTR 区域在转录后水平精准调控基因表达。在肿瘤、心血管疾病、神经退行性疾病等医学领域miRNA 已被证实是重要的诊断标志物和治疗靶点。派森诺云平台 miRNA 分析亮点【smallRNA云平台专题】诺奖热点加持的“寻靶”利器https://mp.weixin.qq.com/s?__bizMzIyNTAxNTc1MQmid2652235871idx1sn50f7717627b0b972cae6c70fcabd6d12scene21poc_tokenHBGRemqjzUCaY3Sm564c0p8T1hLDaPqjf60WSApD02 tsRNA新兴调控明星打开医学研究新维度如果说 miRNA 是 Small RNA 研究的老朋友那么 tsRNAtRNA-derived small RNA包括 tRF 和 tiRNA 则是近年来迅速崛起的新贵。tsRNA 由 tRNA 经核酸酶切割产生广泛参与细胞应激响应、翻译调控、表观遗传修饰等过程在肿瘤发生、神经退行性疾病、代谢综合征等医学领域展现出巨大的 biomarker 潜力。派森诺云平台 tsRNA 分析亮点1. 与 miRNA 对等的全流程深度分析涵盖 tsRNA 鉴定、表达量分析、差异分析、靶基因预测及富集分析等完整模块系统注释 tsRNA 的 tRNA 来源位点区分 5-tRF、3-tRF、i-tRF、tiRNA 等不同亚型以及tsRNA_种类分类、 tsRNA_reads 分类统计等内容图1. 不同类型长度分析统计图2. tsRNA_种类分类统计2.靶基因预测及富集分析GO、KEGG 等功能富集分析揭示 tsRNA 在疾病通路中的潜在作用针对 tsRNA 进行靶基因预测构建 tsRNA-mRNA 调控网络03 医学专属分析从数据到临床转化的加速器派森诺 Small RNA 云分析系统针对医学样本特别设计了专属医学分析模块疾病数据库直接注释统整合疾病相关数据库miR2Disease与HMDD经典miRNA-疾病数据库自动标注与已知疾病关联的 miRNA快速锁定研究焦点。表1. 疾病注释表细胞组成类型分析利用DeconmiR软件基于miRNA表达谱数据对样本的细胞组成进行解析。图3. 细胞组成类型分析机器学习 biomarker 筛选内置机器学习模型随机森林和支持向量机从海量 Small RNA 中智能筛选潜在疾病标志物助力临床转化研究。图4. 机器学习分析WGCNA 加权基因共表达网络分析挖掘 Small RNA 与临床表型、实验处理之间的潜在关联发现关键调控模块。图5. WGCNA分析04 不止于分析更是科研效率的全面提升1. 智能数据管理个性化数据集创建轻松定义样本名称与分组自由修改分析参数适配多样化分析需求多维关联因子灵活编辑实现数据的高结构化整合2. 学术级可视化自定义配色模块支持「离散色板」与「渐变色系」灵活配置一键应用即可让结果图达到出版级要求直接用于论文投稿。3. 零门槛操作五步完成分析新建数据集 → 设置样本分组 → 选择分析参数 → 提交分析→ 查看结果。零基础也能玩转生信真正实现自主分析不求人。写在最后派森诺医学Small RNA 云分析系统以 15 大模块覆盖 miRNA 与 tsRNA 的全流程深度分析以医学专属功能加速从测序数据到疾病标志物的转化路径。无需等待即刻登录派森诺基因云开启您的 Small RNA 医学探索之旅供稿 | 技术服务中心编辑 | 市场部